Основными источниками загрязнений сточных вод таких производств являются сырье и содержащиеся в нем примеси. Сточные воды предприятий формируются на всех стадиях технологического процесса от выпуска продукции до хозяйственно-бытовой деятельности (мытье оборудования и производственных помещений, хозяйственно-бытовые сбросы, сточные воды автохозяйства и ливневые стоки).

Сточные воды пивзаводов характерны высоким уровнем содержания органических веществ (ХПК 4000 – 6000 мг/л), взвешенных веществ, увеличивается риск попадания дрожжей. Наличие дрожжей оказывает негативное влияние на биологические очистные сооружения. При попадании дрожжей в аэробный реактор, где активно используется система аэрации сточной воды, может привести к их размножению, что приводит к нарушению нормальной работы как самого аэротенка, так и последующих стадий обработки.